文書鑑定中所謂之問題文件鑑定項目主要有筆跡鑑定、印文鑑定、偽變造文件及有價證券…等之鑑定。其中各個鑑定項目因其鑑定標的的不同，所採用之方法及認定程序亦有不同，例如，筆跡鑑定可以利用特徵比對；印文鑑定，可應用特徵比對、重疊比對；偽變造文件鑑定則用顯微鏡或各式紫外光、紅外光或不同波段的可見光檢查…等技術。